https://frosthead.com

Første virveldyrart Beskrivelse med DNA-strekkode

I desember 1982 dykket Benjamin Victor, grunnlegger av forskningsinitiativet Ocean Science Foundation for korallrev, i et skjær rett utenfor kysten av en feltstasjon for Smithsonian Tropical Research Institute da han skaffet opp en voksen by. Fisken så litt annerledes ut enn den atlantiske søsken, men funksjonene var ikke unike nok til å erklære den for en ny art.

Victor mistenkte at forskjellene løp dypt inne i gobys genetiske sammensetning, men artenes identifikasjonssystem, basert bare på fysiske identifikatorer som markeringer, antall finner og bein av former, sviktet ham. Han ville trenge en annen prøve og DNA-analyse. Så prøven satt, og satt - på Victor's desk, faktisk - i nærmere 25 år.

I mars 2006 samlet Dave Jones fra National Marine Fisheries Service et larveeksempler som minner om Victor's goby i en felle utenfor Mexicos Yucatan. Derfra tillot den nye taksonomiske teknikken for strekkoding Victor å matche larvenes DNA med den til den voksne og erklære gobyen som en ny art, en som avviker fra sine atlantiske goby kin med hele 25 prosent (husk: mennesker og sjimpanser er bare 1-2 prosent forskjellige).

Fiskens påstand om berømmelse er at identiteten til den er spikret av en DNA-strekkode. Strekkoden, hentet fra et avtalt sted i genomet, fungerer som et forbruksprodukts strekkode ved at den forsegler avtalen når det gjelder identifikasjon.

Gobyen, som heter Coryphopterus kuna, har blitt den første virveldyrarten som har DNA-strekkoden inkludert i den offisielle artsbeskrivelsen. Rundt 30 000 kjente arter, fra sopp til fugler, er blitt strekkode, men i alle tilfeller ble artene funnet og vitenskapelig beskrevet før strekkodene ble opprettet. Barcode of Life-initiativet, hvor Smithsonian Institution er en partner, oppfordrer til at de korte DNA-strengene blir samlet inn og lagt i en åpen tilgangsdatabase.

"Det var ingen måte å gjøre det enkelt og konsistent å identifisere en fisk. Du måtte vanligvis være en ekspert og måtte ha et godt voksenprøve for å undersøke, og da var det din mening, " sier Victor fra taksonomi som før strekkoding. "Nå kan alle med tilgang til strekkodeteknologi si sikkert, sekvensen samsvarer med art X, selv om det du har er et egg, en larve eller en skala eller et stykke hud."

(Med tillatelse av STRI)

Første virveldyrart Beskrivelse med DNA-strekkode