https://frosthead.com

Ambisiøst prosjekt for å sekvensere gener på 1,5 millioner arter

Forrige uke lanserte et globalt konsortium av forskere offisielt Earth BioGenome Project. Som Kate Kelland på Reuters melder, kaller støttespillerne det omfattende initiativet det neste “moonshot for biology.” Anslått å koste 4, 7 milliarder dollar, tar sikte på å sekvensere DNA fra de 1, 5 millioner kjente artene av eukaryotiske eller komplekse arter av liv på jorden . Å ha et DNA-kart over så mange arter, sier forskere, vil gjenskape det vi vet om biologi, økologi og biologisk mangfold.

I følge en pressemelding starter prosjektet med en ny innsats fra Wellcome Sanger Institute, kalt Darwin Tree of Life-prosjektet, som tar sikte på å sekvensere alle 66 000 eukaryote arter som er funnet i Storbritannia i løpet av de neste ti årene. Totalt har 17 institusjoner over hele kloden, inkludert Smithsonian, meldt seg på prosjektet og vil skissere planene sine i løpet av den nærmeste fremtiden.

Foreløpig har forskere bare sekvensert genomene til rundt 3500 arter av sammensatt liv, og bare rundt 100 har blitt sekvensert med "referansekvalitet" som brukes til utdypende forskning. Å legge titusenvis av genom på listen er intet mindre enn revolusjonerende.

"Vi snakker om nye medisiner, nye drivstoff for fremtiden, " sier Julia Wilson fra Sanger Trust til Victoria Gill på BBC. "Vi er for øyeblikket begrenset av våre forestillinger - vi kan ikke en gang forestille oss hva dette vil fortelle oss."

Den ambisiøse ideen kom først sammen i 2015 på et møte spisset av Harry A. Lewin, University of California, og Davis utpekte professor i evolusjon og økologi; Gene Robinson, direktør for Carl R. Woese University of Illinois 'Institute for Genomic Biology; og W. John Kress, forsker botaniker og kurator ved Smithsonians National Museum of Natural History.

Forskerne ble inspirert av Human Genome Project. Mens den historiske sekvenseringen av det menneskelige genomet i 2003 hadde tatt over et tiår å gjøre og kostet omtrent 3 milliarder dollar den gangen (noe som, hvis du tar hensyn til inflasjonen, vil koste anslagsvis $ 5 milliarder dollar i dag), reduserte den enorme innsatsen dramatisk kostnader for sekvenseringstjenester. Det setter dette enorme prosjektet innenfor muligheten.

Når det er fullført, antas det at Earth BioGenome Project vil produsere en eksabyte med data, eller 1 milliard gigabyte, som vil bli delt online gratis.

Det er vanskelig å si hva genkartleggingen vil føre til. "Hullene i kunnskapen vår er mye større enn det vi vet, " sier Lewin til BBC. “Så vi fyller ikke engang inn brikkene i puslespillet; det meste av puslespillet er tomt. ”

Men som Jim Smith, direktør for vitenskap ved Wellcome Trust, påpeker at det samme var tilfelle da forskere først fikk jobbe med Human Genome Project for et kvart århundre siden. "[W] e kunne ikke forestille seg hvordan DNA-sekvensen som ble produsert den gang, ville forvandle forskning til menneskers helse og sykdom i dag, " sier Smith. "Å begi seg ut på et oppdrag for å sekvensere alt liv på jorden er ikke annerledes."

Ambisiøst prosjekt for å sekvensere gener på 1,5 millioner arter